Si lo que quieres es que tu dominio, por ejemplo: tudominio.com abra la carpeta public_html/dominio, entonces tienes que agregarlo como "Addon Domains" apuntando a esta carpeta.
Tu pregunta ya fue respondida y no ha habido respuesta de tu parte asi que procederé a cerrar el tema. De requerir mas ayuda al respecto, puedes reabrirlo.
